MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 75837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008577	ATT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918460
2	NC_008577	CAC	2	6	111	116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918460
3	NC_008577	TTG	2	6	132	137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918460
4	NC_008577	TCA	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918460
5	NC_008577	AGT	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918460
6	NC_008577	GGCA	2	8	189	196	25 %	0 %	50 %	25 %	117918460
7	NC_008577	AGC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918460
8	NC_008577	TTG	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918460
9	NC_008577	CAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918460
10	NC_008577	GTT	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918460
11	NC_008577	T	6	6	591	596	0 %	100 %	0 %	0 %	117918460
12	NC_008577	TAA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
13	NC_008577	T	6	6	804	809	0 %	100 %	0 %	0 %	117918461
14	NC_008577	CAG	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
15	NC_008577	GCT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
16	NC_008577	TTG	2	6	985	990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918461
17	NC_008577	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
18	NC_008577	GAC	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
19	NC_008577	GCA	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
20	NC_008577	ACG	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
21	NC_008577	TGGA	2	8	1206	1213	25 %	25 %	50 %	0 %	117918461
22	NC_008577	TCGA	2	8	1246	1253	25 %	25 %	25 %	25 %	117918461
23	NC_008577	T	6	6	1259	1264	0 %	100 %	0 %	0 %	117918461
24	NC_008577	CAT	2	6	1286	1291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918461
25	NC_008577	CCA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918461
26	NC_008577	GCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
27	NC_008577	TCA	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918461
28	NC_008577	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918461
29	NC_008577	TGCAG	2	10	1486	1495	20 %	20 %	40 %	20 %	117918461
30	NC_008577	CTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918461
31	NC_008577	GAA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117918461
32	NC_008577	TGGTTT	2	12	1583	1594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918461
33	NC_008577	AAT	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
34	NC_008577	CGAA	2	8	1686	1693	50 %	0 %	25 %	25 %	117918461
35	NC_008577	TGG	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918461
36	NC_008577	TGA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918461
37	NC_008577	AAT	2	6	1902	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
38	NC_008577	GT	3	6	1911	1916	0 %	50 %	50 %	0 %	117918461
39	NC_008577	CAA	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918461
40	NC_008577	GTG	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918461
41	NC_008577	TGG	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918461
42	NC_008577	ACC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918461
43	NC_008577	ATC	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918461
44	NC_008577	TTG	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918461
45	NC_008577	TCT	2	6	2345	2350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918461
46	NC_008577	CTG	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
47	NC_008577	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918461
48	NC_008577	AAT	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
49	NC_008577	TGC	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
50	NC_008577	ACC	3	9	2622	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918461
51	NC_008577	ACA	2	6	2632	2637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918461
52	NC_008577	TCT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918462
53	NC_008577	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918462
54	NC_008577	AACT	2	8	3230	3237	50 %	25 %	0 %	25 %	117918462
55	NC_008577	GAACT	2	10	3293	3302	40 %	20 %	20 %	20 %	117918462
56	NC_008577	GT	3	6	3316	3321	0 %	50 %	50 %	0 %	117918462
57	NC_008577	AGC	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918462
58	NC_008577	TTA	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918462
59	NC_008577	CGA	2	6	3383	3388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918462
60	NC_008577	GAT	2	6	3392	3397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918462
61	NC_008577	TA	3	6	3494	3499	50 %	50 %	0 %	0 %	117918462
62	NC_008577	CTG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918462
63	NC_008577	GTG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918462
64	NC_008577	ACT	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918463
65	NC_008577	TAT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918463
66	NC_008577	TGA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918463
67	NC_008577	CT	3	6	3857	3862	0 %	50 %	0 %	50 %	117918463
68	NC_008577	TTCG	2	8	3907	3914	0 %	50 %	25 %	25 %	117918463
69	NC_008577	T	6	6	3928	3933	0 %	100 %	0 %	0 %	117918463
70	NC_008577	GGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918463
71	NC_008577	AGAT	2	8	3958	3965	50 %	25 %	25 %	0 %	117918463
72	NC_008577	ACA	2	6	3978	3983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918463
73	NC_008577	TTACT	2	10	4001	4010	20 %	60 %	0 %	20 %	117918463
74	NC_008577	TTC	2	6	4114	4119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
75	NC_008577	CTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
76	NC_008577	GT	3	6	4278	4283	0 %	50 %	50 %	0 %	117918463
77	NC_008577	GCC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918463
78	NC_008577	TGG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918463
79	NC_008577	TGC	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918463
80	NC_008577	TTG	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918463
81	NC_008577	GC	3	6	4567	4572	0 %	0 %	50 %	50 %	117918463
82	NC_008577	GTT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918463
83	NC_008577	GAT	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918463
84	NC_008577	CTGCG	2	10	4836	4845	0 %	20 %	40 %	40 %	117918463
85	NC_008577	TGA	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918463
86	NC_008577	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
87	NC_008577	TAT	2	6	5047	5052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918463
88	NC_008577	TTC	2	6	5180	5185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
89	NC_008577	GGC	2	6	5206	5211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918463
90	NC_008577	TTC	2	6	5475	5480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918464
91	NC_008577	GGC	2	6	5567	5572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918464
92	NC_008577	TTC	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918464
93	NC_008577	GTG	3	9	5818	5826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
94	NC_008577	ATAA	2	8	5836	5843	75 %	25 %	0 %	0 %	117918464
95	NC_008577	CG	3	6	5874	5879	0 %	0 %	50 %	50 %	117918464
96	NC_008577	GTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
97	NC_008577	ATA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918464
98	NC_008577	GTG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
99	NC_008577	CTTG	2	8	6113	6120	0 %	50 %	25 %	25 %	117918464
100	NC_008577	GAT	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918464
101	NC_008577	CTT	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918464
102	NC_008577	AATC	2	8	6215	6222	50 %	25 %	0 %	25 %	117918464
103	NC_008577	CCA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918464
104	NC_008577	CTTC	2	8	6275	6282	0 %	50 %	0 %	50 %	117918464
105	NC_008577	GC	3	6	6308	6313	0 %	0 %	50 %	50 %	117918464
106	NC_008577	GGC	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918464
107	NC_008577	TGG	2	6	6332	6337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
108	NC_008577	ACC	2	6	6483	6488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918464
109	NC_008577	A	6	6	6540	6545	100 %	0 %	0 %	0 %	117918464
110	NC_008577	CGC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918464
111	NC_008577	T	6	6	6853	6858	0 %	100 %	0 %	0 %	117918465
112	NC_008577	ATAA	2	8	6871	6878	75 %	25 %	0 %	0 %	117918465
113	NC_008577	TCT	2	6	6879	6884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918465
114	NC_008577	GAT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918465
115	NC_008577	CAA	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918465
116	NC_008577	CAGTA	2	10	6917	6926	40 %	20 %	20 %	20 %	117918465
117	NC_008577	GAA	2	6	6949	6954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117918465
118	NC_008577	CAT	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918465
119	NC_008577	T	6	6	7029	7034	0 %	100 %	0 %	0 %	117918465
120	NC_008577	GTA	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918465
121	NC_008577	CATAA	2	10	7109	7118	60 %	20 %	0 %	20 %	117918465
122	NC_008577	ATAGG	2	10	7188	7197	40 %	20 %	40 %	0 %	117918465
123	NC_008577	CTT	2	6	7228	7233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918465
124	NC_008577	CAT	2	6	7243	7248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918465
125	NC_008577	ACC	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918465
126	NC_008577	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918465
127	NC_008577	TGG	2	6	7669	7674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918465
128	NC_008577	CGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918465
129	NC_008577	ACC	2	6	7717	7722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918465
130	NC_008577	TTGA	2	8	7732	7739	25 %	50 %	25 %	0 %	117918465
131	NC_008577	TTGCTC	2	12	7742	7753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	117918465
132	NC_008577	CAT	3	9	7822	7830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918465
133	NC_008577	GCT	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918465
134	NC_008577	AGC	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918465
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